连州市卫生和计划生育局内设机构：办公室(市深化医药卫生体制改革工作领导小组办公室)、医政股(应急办)、食品安全综合协调股、人事股、财务股。

(一)办公室协助局领导的行政管理，负责综合协调局机关政务、事务工作;负责组织会议、文秘档案、机要保密、信息、信访、宣传报导、计划生育、安全生产、后勤保障等日常工作。

(二)医政股(包括医疗、护理、疾病控制、妇幼保健、科技教育、医学会、卫生协会等)负责医疗机构的执业许可审批和管理工作;监督管理医务人员执业标准与服务规范;组织实施医疗机构、医疗技术应用、医疗质量和服务，采供血机构管理等有关政策、规范、标准;承担建立医疗机构医疗服务评价和监督体系的相关工作;指导医院药事、医院感染控制、医疗急救体系建设、临床实验室管理等相关工作;承担推进公立医院管理体制改革工作;参与制定医学教育发展规划，组织实施医药卫生科研项目;贯彻落实中医药发展规划，推进中医药事业的发展;承担有关行政复议和行政应诉工作;负责干部、职工的医学法律知识学习和考试;负责医疗安全生产工作;负责外地医师来本地行医的管理;负责医疗广告审查工作;承担综合管理农村基本卫生保健工作、组织实施相关政策和规划、监督指导农村卫生政策的落实;指导农村卫生服务体系建设，负责卫生协会，管理农村乡村医生的相关工作;拟订有关疾病的防治规划和严重危害人民健康的公共卫生问题的干预措施并组织实施;完善疾病防控体系，防止和控制疾病的发生和疫情的蔓延，承担法定报告传染病疫情信息发布工作;拟订妇幼卫生、健康教育工作规划并组织实施;承担职业卫生、放射卫生、环境卫生和学校卫生相关的监督管理工作，承担公共场所、饮用水等的卫生监督管理;督办医疗卫生违法案件;指导、监督和规范卫生行政执法工作。